第一個難點是各種利益主體的調整。全面推進資源稅改革必然涉及到各方利益，包括政府與企業的關系，降低企業稅負與穩定地方收入的平衡；政府與老百姓的關系，因為資源稅不僅涉及到企業，而且涉及到老百姓的相關利益，社會的敏感性比較大；政府與政府的關系，包括中央與地方，中央和地方在資源稅的稅權劃分上是一個調整，我們給資源稅適度分權，到底分權到什么程度？如何妥善地處理財政分權改革是一個難點。還有地方政府之間就資源稅稅收計征關系，實際上是地方政府核心競爭力的問題。

　　第二個難點是征稅依據，包括稅率與資源價格的依據。確定稅率需要大量的數據，但是一些企業的大數據并不容易獲得。所以科學地確定稅率，對我們也是一個考驗。還有資源價格的決定，將資源稅征收范圍拓展到森林、灘涂，但這些資源價格的確定恰恰是最難的。因為這些資源很難進入生產領域，進入市場流通領域，公共資源面臨的產權關系界定不夠清楚，因此，各方利益包括市場、政府、老百姓、企業利益的調整，將充滿著一定的變數。

　　第三個難點是清費工作的開展，本意是為了減輕企業負擔，規范政府和企業的關系。但是在歷次的清理收費的工作中，發現收費經常容易出現反彈的情況。所以將全面推進資源稅改革與清費工作相結合，也是下一步需要考慮的重要問題。

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